與常規施肥方法相比，經過灌溉系統施肥有以下優點：

①、提高肥料的利用率。水肥被直接輸送到根系泥土，可充分保證養分的有效供給和根系的快捷吸收。因水肥溶液在泥土中均勻散布，使得養分散布高度均勻，提高了根系的吸收效率。對微灌而言，因為濕潤領域僅限于根系集中的區域及水肥溶液最大限度地均勻散布等起因，施肥效率大大提高。因為微灌的流量小，相應地延長了作物吸收養分的時間。在滴灌下，含養分的水滴遲緩滲入泥土，根區泥土水分飽和后立刻停滯灌水，因此能夠減少養分向深層泥土的滲漏，特別是硝態氮的淋失。傳統上施肥和灌溉都是分開進行的，肥料施入泥土后，因為沒有及時灌水或灌水量不足，肥料存在于泥土中，根系并沒有充分吸收。在灌溉時泥土能夠達到水分飽和，但灌溉的時間很短，因此根系吸收養分的時間也短。在田間滴灌施肥系統下種植西紅柿，氮的利用率可達90％，磷達到70％，鉀達到95％。肥料利用率的提高意味著施肥量的減少，從而節儉了肥料。

②、節儉施肥勞力，特別對蔬菜和大棚內栽植的作物尤為顯然。在果樹栽培中，水肥管理耗費大批的人工。如華南的香蕉生產，有些產地的年施肥次數達—5次之多。每次施肥要挖穴或開淺溝，施肥后要灌水。利用設施灌溉施肥后水肥同步管理，可節儉大批勞力。作者在深圳西麗果場（主要種植荔枝）調查發現，采取滴灌施肥后可節儉人工95％以上。現在勞動力價錢越來越高，運用灌溉施肥技巧能夠顯然節儉生產成本。

③、機動、便捷、準確地節制施肥數量和時間。依據作物營養規律有針對性施肥，做到缺什么補什么，實現準確施肥。例如果樹在抽梢期，主要需要氮；在幼果期，需要氮、磷、鉀等多種養分；在果實發育后期，鉀的需求量增長。能夠依據作物的營養特點，擬定各個時期的配方，為作物供給完全營養。依據灌溉的流量和時間，能夠準確盤算每株樹或單位面積所用的肥料數量。

④、施肥及時，養分吸收快捷。對于集約化管理的農場或果園，能夠在很短時間內完成施肥責任，作物生長速率均勻一致，有利于合理部署田間作業。作者對深圳西麗果場的荔枝滴灌施肥時間調查表明，52ha荔枝采取灌溉施肥1人24小時可完成，而以往人工操作情況下需32人1個星期完成。

⑤、有利于運用微量元素。金屬微量元素通常運用螯合態，價錢較貴，而經過微灌系統能夠做到準確供給，提高肥料利用率，下降施用成本。

⑥、改良泥土環境情況。微灌灌程度均度可達90％以上，抑制了畦灌可能造成的泥土板結。微灌能夠維持良好的水、氣情況，基本不損壞原有的泥土結構。因為泥土蒸發量小，維持泥土濕度的時間長，泥土微生物生長茂盛，有利于泥土養分轉化。

⑦、采取微灌施肥方法可使作物在邊緣泥土條件下正常生長。如砂地或砂丘因持水能力很差，水分幾乎沒有橫向擴散，傳統的澆水容易深層滲漏，通常作物很難正常生長。采取微灌施肥技巧，可保證作物在這些條件下正常生長。國外已有利用先進的滴灌施肥技巧開發沙漠、進行商品化作物栽培的成功經驗。以色列在南部沙漠地帶廣泛運用微灌施肥技巧生產甜椒、西紅柿、花卉等，成為冬季歐洲著名的“菜籃子”基地。

⑧、運用微灌施肥能夠提高作物抵擋風險的能力。近幾年來，華南許多地區干旱延續時間長，運用微灌施肥的地塊豐收、穩產，而人工灌溉地塊成苗率低，產量低。微灌施肥的作物因為長勢好，相對提高了作物的抗逆境能力。

⑨、采取灌溉施肥技巧有利于保護環境。我國目前單位面積的施肥量居世界前列，肥料的利用率較低。因為不合理地施肥，造成肥料的極大浪費。大批肥料的散失造成部分地區地下水污染和江河湖泊的富營養化。經過節制灌溉深度，可避免將化肥淋洗至深層泥土，尤其是硝態氮的淋溶喪失能夠大幅度減少，從而避免或減輕泥土和地下水的污染。

⑩、灌溉施肥中水肥互相作用，發揮水肥的最大效益，顯然減少了水的用量。